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常见的两种咖啡树种：阿拉比卡种和罗布斯塔种。
在高海拔地区，阿拉比卡种咖啡生长得最好，这种咖啡的风味比其它咖啡要精致得多，这种咖啡中咖啡因的含量只占咖啡全部重量的1%。
罗布斯塔种咖啡滋味醇厚，抵抗病虫害的能力强，单株产量也很高。该种咖啡生长在低海拔地区，因其能够萃取出丰富且稳定的crema，所以多半被用在意式拼配豆中，用以制作Espresso。
二、过期咖啡销毁之选购指南：
不论是哪一种咖啡，新鲜度都是影响品质的重要因素。选购时，抓一两颗咖啡豆在嘴中嚼一下，要是清脆有声，表示咖啡豆未受潮，而唇齿留香的咖啡豆才是上品，但最好还是用手捏捏，感觉一下是否实心，千万不要买空壳的咖啡。
刚炒好的咖啡豆并不适合马上饮用，一般来说，咖啡的最佳饮用期为炒后一周后，此时的咖啡最新鲜，香味口感的表现最佳。
此外，咖啡豆的风味也是另一个考虑因素。内行人选咖啡豆，倒不见得是看颗粒的大小，咖啡豆在品相上，有可能存在大小不一，例如埃塞俄比亚豆的特性大小不一属于正常现象。其次是色泽，日晒豆在颜色上不论生豆或是熟豆都会存在颜色不一，是正常现象，切勿单方面自行解读书中或是资料中的浅见，将所有咖啡豆都一概而论。相对来说，中深烘的咖啡豆相比浅烘豆更易出油，浅烘豆则不出油或少量出油。总之在选购咖啡时应注意其新鲜度、香味和有陈味。
三、过期咖啡销毁之健康问题：
咖啡是否影响健康是很多人都极为关心的话题，多年以来科学家之间争论不休。但到目前为止，科学研究并未找到确凿证据说明适量地喝咖啡对人体健康有害。在1970至1980年间，这方面研究的结果通常是负面的。广泛的媒体报道使人们对他们饮食内所含的咖啡因感到不安。
进入90年代，由于更严密精确的测验过程及对其他方面更多的了解，例如酒精的消耗，运动习惯和抽烟，这些研究已经能够澄清在从前的研究中一些未解决的争论。特别是已经能提供很多有关咖啡因和健康方面的新知识。
2017年10月27日，世界卫生组织国际癌症研究机构公布的致癌物清单初步整理参考，咖啡因在3类致癌物清单中。